【家出を決意したのび太たちが向かったのは、誰もいない7万年前の日本！史上最大の家出が、時空を超えた大冒険へ。】
ママに叱られ、家出を決心したのび太。ドラえもんやしずかちゃんたちもそれぞれの理由で家出に合流。タイムマシンで向かった先は、まだ人間が誰も住んでいない7万年前の日本。自分たちだけの理想の国を創り、原始時代の生活を満喫する一同。しかし、そこで彼らは時空乱流に巻き込まれ現代へ飛ばされてきた原始人の少年ククルとの出会い。彼の村が、不死の精霊王ギガゾンビとクラヤミ族に襲われたという衝撃の事実。のび太たちはククルを救うため、再び過去へと旅立つ決意。
ママに叱られ、家出を決心したのび太。ドラえもんやしずかちゃんたちもそれぞれの理由で家出に合流。タイムマシンで向かった先は、まだ人間が誰も住んでいない7万年前の日本。自分たちだけの理想の国を創り、原始時代の生活を満喫する一同。しかし、そこで彼らは時空乱流に巻き込まれ現代へ飛ばされてきた原始人の少年ククルとの出会い。彼の村が、不死の精霊王ギガゾンビとクラヤミ族に襲われたという衝撃の事実。のび太たちはククルを救うため、再び過去へと旅立つ決意。