真夜中の名門小学校を舞台に、単純で激情家だが実は怖がりな人体模型が巻き起こす大騒動を描いたオリジナル長編アニメーション。長らく理科室に立ち続けているため天才的な科学知識が身についてしまった人体模型のキュンストレーキは、いたずらばかりする子どもたちが大嫌い。ある学校開放日、両親に連れられてやってきた幼稚園児マコ、ミーコ、ムツコの3人組に好き勝手に飾り立てられてしまったキュンストレーキは、仕返しをするため3人を真夜中の学校に招待する。相棒で心配性の骨格標本ゴスらとともに、3人を待ち受けるキュンストレーキだったが……。