【ゼロ・レクイエムから2年。再編された世界に新たな脅威が迫る時、仮面の男は再び立ち上がる。伝説の続編。】
「ゼロ・レクイエム」から2年。世界は平和を取り戻し、再編成されていた。しかし、難民キャンプを慰問中だったナナリーと、彼女を護衛するゼロ（スザク）が謎のナイトメアフレームに誘拐される。事件の裏には、戦士の国ジルクスタン王国の存在。カレン、ロイドら黒の騎士団の残党は、二人を救出するため潜入作戦を決行する。だが、敵は予測不能なギアス能力を持つ強敵だった。絶望的な状況の中、C.C.はある決断を下す。世界が再び混沌に陥る時、あの男が復活する。
「ゼロ・レクイエム」から2年。世界は平和を取り戻し、再編成されていた。しかし、難民キャンプを慰問中だったナナリーと、彼女を護衛するゼロ（スザク）が謎のナイトメアフレームに誘拐される。事件の裏には、戦士の国ジルクスタン王国の存在。カレン、ロイドら黒の騎士団の残党は、二人を救出するため潜入作戦を決行する。だが、敵は予測不能なギアス能力を持つ強敵だった。絶望的な状況の中、C.C.はある決断を下す。世界が再び混沌に陥る時、あの男が復活する。